L'irrigation des cultures en serre peut se faire par application d'eau à la surface du substrat via des tubes ou des tuyaux de goutte-à-goutte, manuellement à l'aide d'un tuyau d'arrosage, par des arroseurs aériens ou par rampes d'irrigation, ou encore par irrigation souterraine, ou par une combinaison de ces systèmes. L'arrosage par aspersion et l'arrosage manuel ont tendance à « gaspiller » l'eau et à mouiller le feuillage, ce qui augmente le risque de maladies et de dommages. Les systèmes de goutte-à-goutte et d'irrigation souterraine sont les plus efficaces et permettent un meilleur contrôle de la quantité d'eau apportée. De plus, comme le feuillage n'est pas mouillé, le risque de maladies et de dommages est réduit.