Skleníkové plodiny se zavlažují aplikací vody na povrch substrátu pomocí kapacích trubic nebo pásek, ručně pomocí hadice, horních postřikovačů a ramen, nebo aplikací vody skrz dno nádoby pomocí subrigace, nebo kombinací těchto systémů zavlažování. Horní postřikovače a ruční zavlažování mají tendenci „plýtvat“ vodou a také navlhčovat listy, což zvyšuje riziko chorob a poškození. Kapkové a subrigace jsou nejúčinnější a poskytují větší kontrolu nad množstvím aplikované vody. Protože listy nezmoknou, je zde snížené riziko chorob a poškození.