Skleníkové plodiny sa zavlažujú aplikáciou vody na povrch substrátu pomocou kvapkacích trubíc alebo pások, ručne pomocou hadice, horných postrekovačov a ramien alebo aplikáciou vody cez dno nádoby pomocou subarigácie, alebo kombináciou týchto systémov zavlažovania. Horné postrekovače a ručné zavlažovanie majú tendenciu „plytvať“ vodou a tiež zmáčať listy, čo zvyšuje riziko chorôb a poškodenia. Kvapkové a subarigačné systémy sú najúčinnejšie a poskytujú väčšiu kontrolu nad množstvom aplikovanej vody. Keďže listy nezmáčajú, je znížený potenciál pre choroby a poškodenie.